Protein ID: 51473241 |
T4SS name [ID] | VirB [498] |
Gene symbol | - |
Locus tag | RT0028 |
Strain | Rickettsia typhi str. Wilmington |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_006142] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 29679..33143 [-] |
Product | VirB6-like protein of the type IV secretion system |
Component type | VirB6 |
UniProt ID | Q68XX6 |
KEGG ID | rty:RT0028 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 1.4e-25, Aligned region: 294..483 |
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Protein ID: 51473242 |
T4SS name [ID] | VirB [498] |
Gene symbol | - |
Locus tag | RT0029 |
Strain | Rickettsia typhi str. Wilmington |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_006142] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 33268..35928 [-] |
Product | VirB6-like protein of the type IV secretion system |
Component type | VirB6 |
UniProt ID | Q68XX5 |
KEGG ID | rty:RT0029 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 1.5e-20, Aligned region: 516..710 |
Protein Sequence: 886 a.a. [Download] |
>gi|51473242|ref|YP_066999.1| VirB6-like protein of the type IV secretion system [Rickettsia typhi str. Wilmington] MKILKSLVLLVLFIVMPAKAHDTFSWMSTSFSGLKGLFGCLEVPEFTSFQESNIGINLSKAGTWQSTGHT VEKGKLLKINWSIAGVTTEPRKYLVLYRIDPRFSTPQVFIKTYNYSKLQFEALGFPRFVTNSNSSIPGAI PPDKELDALSFTKMSDSIKYYARNNVKIEVKAGDVVNISLVSKDNFFTSNTLDNILTEELDSSIFAASAL YTQSNLGNFDNRIIYASAKEVCDIIDPSRDPNKPSGCSGTGATTKYKSINSNEALVGKPMMIGAVHNFMG LINSCPEHSGINTRPACYYDQGRGMIIKVGGQVIKGRDQSFVKSGRNSFIYYQATRNGIMDFTSDWQVNN MFSNSVLMSDWIRRFLNYPSFIDYINKNDWSANFLYFGRYSMIVEIGNGANSISSDVQQNINLEYLITYD GTLPDPSIRGTPVDYNFSADAPKDGYLWLRVVNPNSNIQGVVSVNYANYTGTTWFSDIVYNGAIKPITDQ FRTFSKNFYIKLIKNSAVQNIAKGSLTLYVIIFGLMFVAGTLKLTAIEVITRICKIAIVAFLIREESWSF FNTYFFSVFTDGIDFFITNVVGATSSRSNIFGFIDPIFDKYTNGRIWGLLFIELLQIHNGLAFIAIITIY SLITYFRAILEVIIGYIIAFIGVTVMISLAPFFIILMLFEKTKSLFDNWISTLLSYVVQPTILLIFFLLI DQVLSEQLLKVVVRACWDTLIPIKIGLDLTNLSIPINFSFTLPFLPGIPFYVPDVPEINRSNIFNNNTNT FLVLFTTALLFYVYCLMSYGLVTFVNIVVGMLTNVTPARISGNYQARSDPVGAVMQDIGSVTTPIKNASM VPARIFKDKIIDQNYKAKKLEGGVEFTNKFFAKRNDVTKKEEGVRE |
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Protein ID: 51473243 |
T4SS name [ID] | VirB [498] |
Gene symbol | - |
Locus tag | RT0030 |
Strain | Rickettsia typhi str. Wilmington |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_006142] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 36090..39005 [-] |
Product | VirB6-like protein of the type IV secretion system |
Component type | VirB6 |
UniProt ID | Q68XX4 |
KEGG ID | rty:RT0030 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 1.8e-31, Aligned region: 615..854 |
Protein Sequence: 971 a.a. [Download] |
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>gi|51473215|ref|NC_006142.1|:c39005-36090 Rickettsia typhi str. Wilmington, complete genome ATGCAGAGTAACTTATTAAAAGTTTTAGGAGTACTCGCTATAGTAGCAACATTAGTTTGCTTTATTTTTG CAGCACTTGGTATGATAGGAGCAGTAAGAATCGGTAACGGCTGTTACATGAGATATTCTAAAGACGGCAA TGGAGGTGCGGATTCAATAACCAATACTATAACCCTTAATGCTAATGCTAATTATTTCAATATTTCTAAG ATGTTGCCTGATGGCACTACTAAGCTTATACCAGATCCTAATCGTTACGGTGAATGGTTAAATACTCAGG TACTAGTAGAAAAAAATCAACAGGTAAATTTACAAGTGGTCGGTCAAGTTAGTTTATGTTTGGCTTATTT ACCAAAAAATAATTTACAATTTACTGAACGTACAAGACCTGGTAAATCGAATCTAGACGATAGCAATCAG ATGATTCCAATTCCACGTGTTCAAGATGCAAATAGCCCACCCGTTTCTCTAATAATGGATGCAAAAAATA ATGAATGGCGTAATATTGCTGAATTATACGCTAATGATAAAGTTTTAGTTTCTGTATCTCCTAATTTTGC TAATACTGATGCAACAGTTGATGACGTTTTTAAAGGTGTGAAGGTTACAAAAGATTGTACACAAGGAAAA ACTTCTTACTATCCGATTTGTGGGAAATATTCTATTTATTCCGGTAAATATGTTACTGCTTGTGAACTGA AGCAAAATTATTGGAAAGGTAATGTGCATCGTGAAGAATGTTATTGTGTTTTTGGATGTATTTATCAAGA AGAAAATGAACAGTGGATATGCGATGCTGCTAATTCTGCTTCTCATTGTTGTACTAGTTTAGTTTGTGAC TCCTTACCTGCTTGGATCAATCACTATAGTAATATGCCGGAAGCTTATAAAGATGATGGCAGTTTTACAT TTAGTTGGTCAGATAAGAGCGGTAATTTATTAATCGATTATCAGGATCTTCAATGTTCTAATAATGTTCA GATCCCTCCAAACGGTGAATGTCCTGATATTGTTGATAATCGTAATCCTAAAGATAAAGATTATATAGGA GGGGTACATTGTACCTCAGGAATATGTAAAGACGGAGATTTTCAAAAAAATCGGAAATTTTGGTATACAG CAGATGGTAAAGGCGGAAAAGGTCCAACCGGATTGATATATCAAATGAATAATACTGGTTCTGTAAGTCA AGCTCTACCTTCTAATCTAGAATTTGCTAAGTTTGTTCCAGAGACAGAACAACCACCTGAATATAAAGAT AAAAACGGTAAATATTTATATAAAGTTATATATAATATACCTTTTAACAGTAATATTGAAAAAAGTTATT TACAATATAGGCTTTGGTCGCCTACATCACAAGATTCTAGTAAGAATACGGGAGGATATGTTTTAAATAT TAAACAGACTAAGTGTTATAGAGAGAATGGTAATAGTTTTAAAGATATTTTTGATGATCGTGGACGAGTA CAATACATAATAGTACAGTCTTCAGAAAATCCGAATACTAGCGGTAAAACTTATGCACCTCAAGGAATTA ATGTTGATAGTGATGGTAAATCTCACTTTAACGCGAATGAGGCTGGTTACATATGGATGAAAATCTTAAA TGATCCTAGTAATAATTTAAAGGACTATAAAGATAGTGAAGGGAGCTATAAAGTGCATTTCTCAACATCA TTAAAAGTAGGCAGTTTTACTATTAAAGTAATGAATCCATTACTTCAGTTATTTAAAACTAAAGTTCAAG GTGCAGCTACTTCTATTTTCAAAAATATGGTATGTTATAAATCTACTGATAATACATCCTGTACTAACTT TTTTACCTATATTAAAGCAATTTTAATCCTATATGTGATGACTTACGGAGCAATGTTCTTGCTTGGTTTT GCTAAGATCAATCAAAAAGAGCTAGTAATTAGAATAGCAAAAATTGGAATGGTTAGCGGACTTATAAATG GTAATACTTTTGAATTTTTCAATAACTATCTTTTTGATGCAATTACTAATTTTTCAGACTCAATTATTGC TAATATGAGTGGATATAGTTTATTTACTTCTACTAATACTATTTCCAATCCTTTTATGTTTTTAGATGCA ATAATGAGTAAAATATTTTTTAGTCAAACCTTTATTGCGCAATTACTTTCACTTCTTTCCCTTGGACTTA GCGGTATTATATATTTTATAATTACTTTTATTGCTGTTTGTATAGTCATTATTACGACACTTAGAGCTAT TGCCGTTTATATTATGGCATTTATGGCGACTTGCATATTAATCGGTATAGCACCTTTATTTATTAGTTTT TTATTATTTGATTTTACTAGATATTTATTTGATAATTGGGTAAGATTTACGATCCGCTATATGATAGAAC CGGTAGTTATGATGGCAGGTATTATCGTATTAACTCAACTATTTACAATTTATCTAGATTTTGTTTTAGG TTATAGCGTTTGTTGGAAATGTACTTTACCGATCAAAATTCCATTTATTGGCACTATTTTGCCTATTGCA TTGCTAAATGTACCTATCTTCTGTATTAATTGGTTTGCACCTTGGGGAATGGACTATATGTCAGGTATGA TGGGAGTAAATATGCAAAATATTGTAGCTTTAGTTATTATTGCTTATGGTATGTATGGTTATGTCGAATT TTCAGGTCGAATGGTAGCAAAATTAACTAGTGCTGCAGGACCTTCTGCTACTCAAATTGGTGATAGAATG TCTCATGATGCTGGACAAAAAACATTAAGTCAAATAGGAATGGATTATAGAACAAGAAAAGGTATTACCA GCAGAGCAAAATCAAGATTAAAACAACGCAATAGGACATTAGAACATGCTGAGCAAAATAGCAAAAAATA CATGAAAAAAATTGGTGAGAATACAAATGAAGGAACACTAAAATAA |
Protein ID: 51473244 |
T4SS name [ID] | VirB [498] |
Gene symbol | - |
Locus tag | RT0031 |
Strain | Rickettsia typhi str. Wilmington |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_006142] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 39009..41033 [-] |
Product | VirB6-like protein of the type IV secretion system |
Component type | VirB6 |
UniProt ID | Q68XX3 |
KEGG ID | rty:RT0031 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 2e-14, Aligned region: 405..495 |
Protein Sequence: 674 a.a. [Download] |
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Protein ID: 51473245 |
T4SS name [ID] | VirB [498] |
Gene symbol | - |
Locus tag | RT0032 |
Strain | Rickettsia typhi str. Wilmington |
Replicon | chromosome [GenBank: NC_006142] [Browse all T4SS(s) in this replicon] |
Location [Strand] | 41020..44427 [-] |
Product | VirB6-like protein of the type IV secretion system |
Component type | VirB6 |
UniProt ID | Q68XX2 |
KEGG ID | rty:RT0032 |
PDB ID | NA |
Domain hit(s) vs Pfam | TrbL [PF04610], Evalue: 3.4e-11, Aligned region: 505..580 |
Protein Sequence: 1135 a.a. [Download] |
>gi|51473245|ref|YP_067002.1| VirB6-like protein of the type IV secretion system [Rickettsia typhi str. Wilmington] MALFPRGILIALVLSFVLNLGLVTKIHAKDTLDSIIDILSGLTCETQGVGDLMRTEFSHTCIVAPFFTFA VMNLVSPVLYMNTFLKLKINDSDLFNDSNFGNFPGGQCTRENRIDPKNPELHFALCSNAKLIVSRAKSVT ESALAIAKAVLTWSDPWDDIKQAWENKKKEYHIPYRGKPGDDGFAFDVGFPVIYWKVIQDRDRICVSTKG FTGDVPVGCKYMKEPFPKSIYNSFIDVEDKNFIKDSTNDTPSDPLALVSCSAAGDGCYQKAYNASKTAIV MTSPLIECIRQMIARLLISKDVCSFDNVDQVVNLASRQDSALFQFQVGMHKIVTAFLTLYVMFFGFKLLL AGKVPPKSEYINFILKIIFVTYFSIGININPSNGSQYDRLDGMIQWVFPFLLNGISGLANWVMNAAPSGL CKFNNISYDKSVSYIALWDALDCRVAHYLGLDILSTLLVENSYRSHDFLNFDFFSFSAPPYIYLIIPAII SGNMMLVSLALSYPLLVISVAAFMVNATIMCMISIVILGILAPLFVPMFLFAYTRNYFDSWVKLMISFLL QPMVVVTFMITMFAVYDYGFYGKCQYKSKLIHNSIEDKMQGGIKSKRDVLIFYINNDWDDTSQYPDKDSV ESCKNSLGYMLNNPINTAFNFAKDNISEIVNSKPGETTTDEFLSKFQFLSGVVLGPGMFFMSPKVLFEKI KNIFLALITACFTLYLMYNFSSQLAEFAADMTEGVALNNVAIKPQAIFKAAMAALANAGTATKGIDQIAS RGGGGGARDLIGAKGLVSDNIASSGGAVGDNIASSGGAVGDNIAVSGAASTPTVTTTTASSSIANSMTKT IGDDVRSDIVTPHASTTAVPQHSSINTTIPTSVSPNIKSTSLKEIIRDNQENEKEIDNTTRAQEKIKSSS KVSGLIDYSFNLKEHDNPTGIKQIRENAEIRDKRVEVEKAWNELVASGGGRIRDQQSEETSEQRTNAEKK WNEFVDSGVVTEIREIDNSVNNKLADKLDKSEKSKIEENKNIENNIKVYNTNTLPQEKVNNTDKSSGLID YSFNLKEHDNPTGVKQIRENAEIRDKRVKVEKAWNELVASGGGRVKEQAGGKITERRANAEKVWDDLVKS GVVKEKKDNSSNENS |
Nucleotide Sequence: 3408 bp [Download] |
>gi|51473215|ref|NC_006142.1|:c44427-41020 Rickettsia typhi str. Wilmington, complete genome ATGGCATTATTCCCTCGTGGTATACTGATAGCATTAGTACTGAGCTTTGTCCTAAATTTAGGTCTAGTGA CTAAAATTCATGCTAAAGATACTCTTGATAGCATTATAGATATTTTGAGTGGCTTAACTTGCGAAACACA AGGTGTAGGTGATTTAATGCGTACTGAATTTTCACATACATGTATTGTCGCTCCGTTTTTTACTTTTGCG GTAATGAATCTTGTATCTCCCGTTTTATACATGAATACATTTTTAAAGCTTAAAATAAATGACAGTGATT TATTTAACGATAGTAATTTTGGGAATTTTCCCGGAGGTCAATGTACTCGTGAAAACAGAATTGATCCTAA AAATCCAGAATTACATTTTGCTCTATGTAGTAATGCTAAATTAATTGTATCGCGTGCAAAATCAGTTACA GAATCGGCACTTGCTATTGCTAAAGCCGTCTTAACATGGAGTGATCCTTGGGATGATATAAAGCAAGCGT GGGAAAATAAAAAAAAGGAATATCATATTCCATATAGAGGTAAGCCTGGTGATGACGGTTTTGCATTTGA TGTAGGCTTCCCTGTAATATATTGGAAAGTTATTCAAGATAGAGATAGAATATGTGTCTCAACAAAAGGG TTTACAGGAGATGTGCCAGTCGGCTGTAAATATATGAAAGAGCCGTTTCCAAAATCCATATATAATAGTT TTATTGATGTAGAAGATAAGAATTTTATTAAAGATTCAACAAATGACACACCTAGCGATCCTTTAGCTTT AGTTTCCTGTAGTGCTGCAGGAGATGGGTGTTATCAAAAAGCTTATAATGCTTCAAAAACTGCAATAGTC ATGACTTCTCCTCTTATAGAATGTATAAGGCAAATGATTGCTAGATTACTAATTAGTAAAGATGTTTGTA GTTTTGATAATGTAGATCAAGTTGTGAATTTGGCATCAAGACAAGATAGTGCATTATTTCAGTTCCAAGT AGGCATGCATAAAATAGTTACGGCTTTTTTAACTTTATATGTTATGTTTTTTGGTTTTAAGTTATTACTT GCAGGTAAAGTGCCGCCAAAAAGTGAGTATATAAATTTTATATTGAAAATAATATTTGTAACTTATTTTT CAATAGGAATTAATATAAATCCTTCTAATGGTTCTCAGTATGATCGGTTAGATGGAATGATTCAGTGGGT GTTTCCTTTCTTACTTAACGGTATAAGCGGTTTAGCAAATTGGGTTATGAATGCTGCTCCGTCTGGTTTA TGTAAATTTAATAATATTTCTTATGATAAAAGTGTTTCATATATTGCATTATGGGATGCATTAGATTGTA GAGTTGCTCATTATTTAGGACTTGATATATTATCTACTTTACTTGTAGAAAATTCGTATCGAAGCCATGA TTTTTTAAATTTTGATTTCTTTAGTTTTAGTGCCCCACCATATATTTATTTAATAATTCCAGCAATAATC TCTGGTAATATGATGTTGGTATCACTTGCACTTTCTTACCCGTTACTGGTGATTTCTGTCGCTGCATTTA TGGTTAATGCAACAATTATGTGTATGATATCTATAGTCATACTCGGTATTCTAGCTCCTCTTTTCGTGCC TATGTTCTTATTTGCGTATACACGAAATTATTTTGATAGCTGGGTTAAGCTGATGATTTCATTCTTGCTA CAGCCTATGGTAGTAGTCACGTTTATGATTACGATGTTTGCAGTATATGATTATGGCTTTTATGGTAAAT GTCAATATAAGAGCAAGTTAATTCATAATAGCATAGAAGATAAAATGCAAGGTGGTATAAAATCTAAGAG AGATGTTTTAATATTTTATATTAATAATGATTGGGATGACACATCACAATATCCTGATAAAGATTCAGTA GAGAGTTGTAAAAATAGTTTAGGGTATATGTTAAATAACCCTATTAATACAGCATTTAACTTTGCAAAAG ATAATATCAGTGAAATAGTTAATAGTAAACCTGGTGAGACCACTACTGATGAATTTCTTTCTAAATTTCA GTTTTTATCAGGAGTTGTTTTGGGTCCTGGTATGTTTTTTATGTCGCCAAAAGTGCTTTTTGAGAAAATT AAAAATATTTTTCTTGCATTAATTACTGCATGTTTTACATTGTATTTAATGTATAATTTTAGTAGTCAAC TAGCTGAATTTGCTGCAGATATGACAGAAGGAGTTGCGCTTAATAATGTTGCTATCAAGCCACAAGCAAT ATTTAAGGCAGCTATGGCAGCGCTTGCTAATGCTGGTACTGCAACTAAGGGTATAGATCAGATAGCAAGC CGTGGAGGAGGTGGAGGTGCACGTGATTTAATTGGAGCTAAAGGATTGGTAAGTGATAATATAGCTTCAA GTGGAGGTGCTGTCGGTGATAATATAGCTTCAAGTGGAGGTGCTGTCGGTGATAATATTGCTGTGAGTGG AGCTGCGTCAACACCTACAGTAACAACAACTACAGCTTCGTCTTCAATAGCAAATTCTATGACAAAAACT ATAGGTGATGATGTAAGATCAGATATTGTCACTCCTCATGCTTCTACAACAGCTGTTCCACAGCATTCTA GCATTAATACTACTATTCCTACATCTGTATCACCTAATATTAAATCTACAAGTCTTAAGGAAATTATTAG AGATAATCAAGAAAATGAAAAAGAGATCGATAATACTACGCGTGCACAAGAAAAAATTAAAAGTTCAAGT AAAGTTTCAGGACTAATTGATTATAGTTTTAACTTAAAGGAACATGATAATCCAACAGGAATAAAACAGA TAAGGGAAAATGCAGAGATTCGTGATAAACGTGTAGAAGTAGAGAAAGCATGGAACGAATTAGTGGCAAG TGGTGGAGGCAGAATAAGAGATCAACAAAGTGAAGAAACATCGGAGCAACGTACTAATGCAGAAAAGAAA TGGAATGAATTTGTTGATAGCGGTGTAGTAACTGAAATAAGAGAAATTGATAATAGTGTCAATAATAAAT TAGCTGATAAACTTGATAAATCAGAAAAATCAAAGATAGAAGAAAATAAAAATATAGAAAATAACATTAA AGTCTATAATACTAATACGTTGCCACAAGAAAAAGTCAATAATACAGATAAAAGTTCAGGACTAATTGAT TATAGTTTTAACTTAAAAGAACATGATAATCCAACAGGAGTAAAACAGATAAGGGAAAATGCAGAAATTC GTGATAAACGTGTAAAAGTAGAAAAAGCATGGAATGAACTAGTCGCAAGTGGAGGTGGAAGAGTAAAAGA ACAAGCAGGAGGAAAAATAACAGAACGACGTGCAAATGCAGAAAAGGTATGGGATGATTTAGTTAAAAGT GGTGTAGTAAAAGAAAAAAAAGATAATAGTTCTAATGAAAACTCTTAA |